深圳市大鹏新区博物馆（原大鹏新区大鹏古城博物馆，成立于1996年），是深圳首个全国重点文物保护单位——大鹏所城的文物保护专门管理机构。2005年，被公布为广东省爱国主义教育基地。2009年，被国家文物局评为“国家三级博物馆”。2021年1月更名为深圳市大鹏新区博物馆，增加全国重点文物保护单位——东江纵队司令部旧址文物保护工作职责。
        一、大鹏所城场馆（南门楼、赖恩爵振威将军第、怡文楼、戴氏大屋、罗贵旧居）

　　南门楼：为大鹏所城正门，始建于明洪武二十七年（1394），坐北朝南，面阔25米，进深12米，占地面积约300平方米，通高11米。南门正面有城墙、马面、城垛（雉碟）等，现状城墙由三个颜色形成三个年代层次，最下方青灰色部分为明代初年，中间红色部分为1984年重修，上面的城垛和门楼为1998年重修。城门前矗立着三块石碑，分别是“国保碑”、“名村碑”和“中国传统村落碑”。“国保碑”指大鹏所城2001年被国务院公布为全国重点文物保护单位，是深圳市第一个“国保”；“名村碑”指大鹏所城于2003年被建设部和国家文物局评选为首批中国历史文化名村，当时全国仅有12个古村入选首批名村。

　　赖恩爵振威将军第：位于大鹏所城赖府巷15号，建于清道光二十四年（1844年），道光皇帝御赐的“诰封第”。赖恩爵（1795—1849年），字简廷，大鹏所城赖氏“三代五将”之一。鸦片战争抗英将领，官至广东水师提督，封振威将军。赖恩爵于1839年9月成功指挥了“九龙海战”，拉开了第一次鸦片战争的序幕，吹响了中国近代反侵略的号角。

　　怡文楼：位于大鹏所城赖府巷10号，建于清道光二十六年（1846年），坐东朝西，面宽23.6米，进深15.3米，面积360平方米，为砖木结构，高二层，中有天井，天井两侧均为三开间布局。整体建筑有条石墙裙，条石上结砌青砖，堆瓦屋面，硬山顶，船形脊。怡文楼曾作为赖氏家族培养子孙的“崇兰书室”。现开辟为“鹏城春秋—大鹏古城历史展”、大鹏新时代文明实践中心和大鹏自然童书馆。

　　戴氏大屋：位于大鹏所城戴屋巷6号，建于清末，坐北朝南，平面布局为三进两天井，砖木结构，占地面积约300平方米，为所城典型的民居式建筑，但其大门规格较一般民居高大雄伟。建筑特征有条石墙基，木构架，堆瓦屋面，地面铺大阶砖。

　　罗贵旧居：位于大鹏所城长巷009号，建于清代晚期，整座建筑坐北朝南，占地面积52平方米。常设展览“从麻糖仔到参谋长——罗贵的革命人生”展览。

　　二、东江纵队司令部旧址

       土洋村东江纵队司令部旧址，始建于民国元年（1912年），占地面积约400平方米，建筑面积约270平方米。 土洋村东江纵队司令部旧址见证了广东人民特别是大鹏革命先辈在艰苦条件下英勇抗日的风雨历程。广东人民抗日游击队东江纵队领导广东人民进行英勇的抗日斗争。东江纵队司令部旧址由主楼、礼拜堂、烈士纪念碑等附属建筑组成，为土砖木结构建筑，外观与装饰具有西洋建筑色彩。主楼为司令员曾生等领导人工作和居住的场所，礼拜堂则作为会议室和作战室，附属用房改为工作人员的工作用房。